重庆市科学技术研究院是整合原属中央和地方的10个研究院所于2008年重组而建，是集研究开发、技术转移、成果转化、人才培训和国际交流为一体的工业技术的综合研究机构，是重庆市组建的最大的科学研究和科技创新服务机构，辖有“重庆工业自动化仪表研究所”、“重庆光学机械研究所”、“重庆市生物技术研究所”、“重庆日用化学工业研究所”、“重庆硅酸盐研究所”、“重庆高技术创业中心”、“重庆机电设计研究院”、“重庆食品工业研究所”、“重庆市机械工业理化计量中心”等9个转制所（中心）和“重庆模具研究中心”、“重庆信息与自动化技术研究中心”、“重庆新材料研究中心”、“重庆汽车（摩托车）零部件研究中心”、“重庆生物医药研究中心”、“重庆石油化工研究中心”、“重庆技术评估与转移服务中心”、“重庆科技检测中心”等9个事业性质的中心，共有人员2000多人。重庆市科学技术研究院还出资设立了“重庆市应用技术有限公司”，负责科技研发、成果转化和转制院所国有资产管理。